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海星:为什么要进行细胞STR鉴定?

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发表时间:2023-03-09 13:26作者:诺扬生物来源:海星生物科技

据统计约30%细胞系被交叉污染或错误辨识,只因使用了交叉污染或错误辨识的细胞而导致研究结论错误、结果不可重复、临床细胞治疗灾难性后果……,这将浪费大量时间、精力和金钱。

世人皆知,细胞身娇体贵难养活,养好细胞实属不易。而这其中最烦的是污染、最怕的是掉包。因为尽管研究僧们有方法把一切污染的源头扼杀在摇篮之内,却没有火眼金睛辨别已经换了马甲的错误细胞。因而细胞一旦被李代桃僵,再资深的科研者都会阴沟里翻船,所以细胞鉴定显得尤为重要。



为什么要进行细胞系鉴定?

进行细胞系STR鉴定是很重要的。很多生物医药的研究都采用培养细胞来进行,这些细胞可能是受赠于其它研究人员,也可能是从细胞库(如美国 ATCC,American Type Culture Collection)得来。据估计,15-20%的实验室,实验中所使用的细胞已经不是原来的细胞系,或者与其它细胞系发生了交叉污染。显然,细胞系遭到污染、特征鉴别错误,将会极大的威胁着基于这些细胞而发表的论文质量和研究发现的正确性。



什么情况下需要细胞系鉴定?

1. 当建立或获得一个新的细胞系时;

2. 一个涉及到细胞试验项目开始/结束时;

3. 在细胞冻存之前,或细胞已连续培养 2~3 个月时;

4. 发表文章或申请课题经费前;

5. 细胞系表现不稳定或结果与预期差别较大时;

6. 当实验室使用超过一种细胞系时,所有细胞系最好先鉴定以排除交叉污染的可能。


如何根据STR数据判断细胞系身份?

收到细胞系鉴定结果以及 STR 信息,可以与参考数据库进行比对。如果细胞样本的每个 STR 位点和参考细胞 STR 位点都能重合匹配,即说明该细胞系正确,反之则说明你的细胞系可能被错误标记,交叉污染或发生遗传不稳定。一般说来,匹配度≥80%即可认为该细胞系正确,匹配度<80%则说明该细胞系的来源需要被怀疑。

如果细胞系被鉴定出发生交叉污染或错误标记,则需要拿更早代数的细胞进行鉴定,从而找到问题的起源或者直接从可靠的机构购买一株新的细胞系。


海星生物细胞STR鉴定服务

STR(Short Tandem Repeat,短串联重复序列)基因分型已被ICLAC、ATCC等权威机构作为鉴别细胞身份及交叉污染的金标准。海星生物对人源细胞21个STR位点进行检测,可方便与权威数据库进行比对,具有极高的准确性。

STR基因位点由长度为3~7个碱基对的短串连重复序列组成, 这些重复序列广泛存在于人类基因组中,可作为高度多态性标记,被称为细胞的DNA指纹。STR 基因座位上的等位基因可通过扩增区域内重复序列的拷贝数的不同来区分,在毛细管电泳分离之后可通过荧光检测来识别。随后通过一定的计算方法,即可根据所得的STR分型结果与细胞STR数据库比对从而推算出样品所属的细胞系或可能的交叉污染的细胞系名称。


海星生物细胞系鉴定位点

人源细胞STR位点信息

TH01

AMEL

TPOX

D3S1358

D12S391

D5s818

VWA

D13S317

D75820

D2S1338

D8S1179

D6S1043

CSF1PO

D21S11

D19S433

D16S539

FGA

D18S51

PENTAD

PENTAE


细胞系鉴定服务流程

海星生物细胞STR鉴定技术服务优势

  1. 1. 准确率高

  2. 2. 服务全面

  3. 3. 周期短




















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